垂直轉(zhuǎn)子(vertical rotor)與角轉(zhuǎn)子、甩開轉(zhuǎn)子相比，不僅縮短了離心時間，而且也獲得了相當高的分辨率。在垂直轉(zhuǎn)子中，裝放溶液的離心管在離心過程中保持垂直，即與旋轉(zhuǎn)軸間的夾角為零度。

　　垂直轉(zhuǎn)子中梯度的重定向過程如圖2-9所示。在緩慢加速過程中，由于重力場和離心力場的共同作用，梯度水平面從離心管AB邊向離心管底部CD移動，離心管底部的高濃度面沿Bb邊向上移動，轉(zhuǎn)子速度不斷升高，梯度由水平剖面漸漸地轉(zhuǎn)變成垂直剖面。梯度的最大密度部分在Rma:處，最小密度部分在Rmin處。這種重定向過程在轉(zhuǎn)子速度到達70-800r/min就基本完成。

　　在垂直轉(zhuǎn)子的梯度離心中，加速和降速過程必須緩慢進行，這是為了防止過大的切向力干擾梯度及梯度中的樣品。轉(zhuǎn)速超過1000r/min時，由于梯度在較強的離心場中已穩(wěn)定，可按正常加速、降速程序進行。在小直徑的試管中，如果降速太慢，梯度的分辨率就不好，其原因尚不清楚。一般情況下，對于直徑1cm或更小的試管，建議采用較快加速和降速。而對于直徑大于1cm的試管，則采用較慢加速和降速。